Das BIOS ist völlig unabhängig vom benutzen Betriebssystem. Es ist also egal ob man Windows, Linux, OS/2 oder BeOS benutzt, dass BIOS und seine Funktion bleibt immer gleich.

Im festen Speicherbereich liegt ein Programm vor, was unmittelbar nach dem Starten des Computers aktiv wird und nach einen bestimmten Ablauf den PC Leben einhaucht.

Auf dem ersten Blick kann ein AT von einem ATX Motherboard auf Grund der Anordnungen der Schnittstellen unterschieden werden. Die Buchsen für USB, Serial und Parallel sind bei einem ATX-Board auf der Platine direkt drauf. Anders beim AT-Board wo die Buchsen separat am Gehäuse befestigt sind und mit Kabeln zum Board geführt werden.

weitere Unterschiede:

• Die Stecker für die Stromversorgung sind unterschiedlich da auch die Netzteile andere Spannungen zusätzlich Ausgeben.
• ATX Boards unterstützen, in der Regel, im vollem Umfang die Power Management Funktion mit der es möglich, den Rechner in Standby Modus zu fahren, wake up-Funktion, usw.
• Jedes ATX Board hat eine PS2 (MiniDIN) Anschluss für die Maus, somit ist ein weitere Serieller Anschluss frei.
• Die CPU befindet sich in der nähe des Netzteils, womit eine bessere Kühlung respektive Luftzirkulation möglich ist.
• Die Boards sind mechanisch kleiner und kompakter, was kleinere Gehäuse ermöglicht
• Auf ein ATX Board ist mindestens ein Pentium II Prozessor drauf.
• Die Mainboards unterstützen PCHealth Funktion um z.B. die Temperatur des Prozessors zu überwachen oder die Drehzahl des Lüfters zu kontrollieren.